精子分离术是一项主要用于预防胎儿患伴性遗传性疾病的技术，同时此技术也能起到一定的胎儿性别选择作用，若我们将此技术用于预防胎儿患上遗传病，那么此技术是没有任何危害的，而我们若将此技术用于筛选胎儿的性别，也不会有什么太大的危害，但是却会产生以下几点不好之处。

1、选择性别成功的几率不高

由于Y染色体跑得会快一些，X染色体异精子跑得慢一些，而精子分离术并不是指将将X染色体精子与Y染色体精子分离，而是将活动率高的精子和活动率低的精子分离，所以此技术并不能100%选择胎儿的性别，通过此技术怀孕，还是会有很大的几率生下与自己选择性别想法的孩子。

2、性价比不高

国内对于辅助生殖技术的管控非常严格，是不允许选择性别的，所以若想通过此技术选择胎儿性别只能去国外，而国外对于此技术的收费又比较高，可此技术选择性别的几率又不是非常高，所以这样来看，使用精子分离术选择性别的性价比是比较低的。

精子分离术虽然没有什么危害，但是对于想通过此技术选择胎儿性别的人群来说，此技术却有着一项非常大的坏处，那就是性价比极低，因为在亚洲内几个可用此技术选择性别的国家，对于此技术的收费都是非常昂贵的，其收费详情如下：

1、泰国，泰国是一个通过辅助生殖技术选择性别完全合法的国家，而此国内精子分离术的费用标准大约在一次12000元人民币左右。

2、日本，日本是亚洲内少有的几个发达国家之一，所以对于此技术的收费标准是比较贵的，一次收费大约为10000元人民币-150000元人民币。

3、柬埔寨，柬埔寨是一个对于辅助生殖技术的管控极度宽松的国家，虽然此国的物价水平低，但是在此国内做一次精子分离术的费用却不低，大约为10000元人民币。

所以由此可见，在国外通过此技术选择性别的性价比是非常低的，因为这种技术在国内一次只需要1000元-2000元左右。

虽然精子分离术对于想选择性别的人群来说全是不好之处，但是此项技术被研发的初衷便是帮助患有遗传病的人群预防下一代也患上遗传病，所以此技术对于这类人来说是有着非常大的好处的，而其好处主要有两点：

1、可预防胎儿患遗传病，因为这一点本就是此技术的初衷，所以自然是其一大好处。

2、性价比高，在国内通过此技术来预防下一代患遗传病只需要花几千元即可，而有相同作用的第三代试管婴儿技术却需要几万甚至十几万，所以对此之下，精子分离术性价比是非常高的。