深圳做羊水穿刺的检查费用相对较高，没有具体的收费标准，费用大概在3000-5000元不等，由于深圳不同区域，不同级别的医院进行此项检查的收费标准也就不同。孕妇做羊水穿刺主要看需要检查的项目，以及其他检查操作费用来决定具体的花费，建议咨询相关医院详细了解一下。

深圳市妇幼保健院做一次羊水穿刺5000多元也属于正常标准范围内，不算贵，如果羊水穿刺是做染色体基因芯片检测，则需要5000-7000元不等，若只是做23对染色体数目的检查总共花3000多元，而单纯做一次羊水穿刺检查费用在2000元左右，主要还是和女性检查的具体项目有关，毕竟做羊水穿刺的费用在三千或五千的区别就在于检测的数目不同，女性可以根据自身情况或医生的建议来选择。

羊水穿刺主要检查胎儿染色体是否异常，属于一种微创检查，但有一定的风险，其准确率并不是100%准确的，需要通过各种检查结果综合得出最后的诊断性结果。如果没有染色体异常的话，建议慎重考虑。注意羊水穿刺并不是常规检查项目，是不能够报销的，需要自费。深圳有多家正规的三级甲等医院可以做羊水穿刺，每个医院可能收费的标准不同，建议先了解情况再做选择。