根据相关了解，女性患者在医生的嘱咐下在第二次胚胎移植打肝素一般是没有太大影响的，但有少部分患者可能会出现出血、血小板减少症和其他副作用：

1、出血：为主要的不良反应，常表现为各种黏膜出血、关节腔积血和伤口出血等；

2、血小板减少症：常为肝素引起的一过性血小板聚集作用所引起，一般发生在给药后的7~8天，可能与免疫反应有关；

3、其他：偶可见过敏反应，例如哮喘、荨麻疹、结膜炎和发热等。长期应用可引起骨质疏松和骨折。孕妇应用可导致早产和死胎等。

以上就是患者打肝素的副作用，因此建议各位患者严格按照医生指导使用，并提前了解清楚依诺肝素钠注射方法，另外要注意，该针剂不是所有患者都能使用，例如存在肝素过敏、有出血倾向、紫癜、孕妇、产后、肝肾功能不全等情况的患者都不建议使用，否则可能会导致比较严重的后果，另外，用药期间一旦有不适，建议及时就医，进行诊治。

第二次胚胎移植打肝素一般是有用的，因为肝素是一种抗凝血药物，通过抑制凝血酶的活性来预防血栓形成。在胚胎移植过程中，肝素可以改善子宫内膜的血液循环，并提高着床率。此外，肝素还具有抗免疫反应和抗炎作用，有助于降低免疫排斥反应和减少子宫内膜的炎症反应。只是要注意，在决定是否使用肝素之前，需要进行详细的身体检查和评估，并与医生进行充分的沟通和讨论。