南京鼓楼医院的生殖中心是国家卫生部首批批准开展人类辅助生殖技术5家单位之一，不孕患者可以到该院做三代试管婴儿，但是费用较高，可能是以下这些因素导致的：

1、患者自身的身体情况：如果患者的身体情况比较差，则可能会在一定程度上影响试管婴儿的费用；

2、检查费用：试管婴儿的检查费用，包括夫妻双方的血常规、尿常规、肝肾功能、传染病等检查，以及女性的子宫、卵巢、输卵管等部位的B超检查等，这些检查项目的费用通常在2000-3000元左右；

3、用药费用：试管婴儿的用药费用，包括促排卵药物、促性腺激素、黄体酮等，这些检查的费用通常在10000-20000元左右；

4、手术费用：手术费用在不同的医院收费标准是不一样的，一般在几千元到几万元不等；

5、其他原因：如果在试管婴儿的过程中出现并发症，则可能会在一定程度上影响试管婴儿的成功率。如果在取卵时，出现卵巢过度刺激综合征，则可能需要进行相应的治疗，治疗费用可能会在10000-20000元左右。

另外，不同促排卵方案用药种类及用药量不同。相比而言，微刺激方案、自然周期方案、黄体期方案因为用药较少，因此需要的治疗费和药费低于其他方案。总而言之，建议患者做试管期间积极配合医生改善情况，以此来降低费用。需注意，鼓楼医院试管能否报销还要看当地的政策要求，患者最好咨询专业人士，以便做好相应的准备。