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北京朝阳医院是三级甲等医院，北京协和医院也是三级甲等医院，所以这两家医院并不存在谁等级高一点的说法，都是一样的。从临床来说，北京朝阳医院建于1958年，是北京市政府举办的集医疗、教学、科研、预防于一体的三级甲等综合医院。
另外，北京协和医院则是集医疗、教学、科研于一体的现代化综合三级甲等医院，是国家卫生健康委指定的全国疑难重症诊治指导中心，最早承担干部保健和外宾医疗任务的医院之一，目前是高等医学教育和住院医师规范化培训国家级示范基地。
北京朝阳医院和协和医院的呼吸科都比较好，北京协和医院呼吸内科作为我国最早成立的呼吸科专业科室之一，是我国一流的呼吸科学临床和研究中心及呼吸疑难病诊治中心，拥有众多的我国呼吸专业的老前辈或知名教授，而首都医科大学附属北京朝阳医院呼吸与危重症医学科也不错，现在已发展成为呼吸医学领域集医、教、研、防于一体的现代诊治中心与人才培养基地的。
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