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男性y精子染色体异常缺失确实只能生女孩儿不能生男孩儿，对男性来说是XY染色体，在没有这条染色体的情况下，只能遗传X染色体，所以不能生下男孩儿。不过具体还需要进行基因检测才能明确诊断才行，建议大家想去三甲医院做个身体健康再做打算。
一般男性y染色体异常，建议做三代试管婴儿，因为染色体异常虽热能够生女孩，但并不能保证胎儿百分之百健康，因为这具有遗传性质，如果自然怀孕的话，可能会导致胚胎发育不良，出现胎儿发育畸形的情况。而做试管可以通过筛选出健康的胚胎进行移植，从而减少这种概率，当然，具体如何选择还是要看自己的意愿。
此外，男性Y染色体缺失，除了遗传因素，还可能是基因突变等原因造成。会造成严重少弱精子症，导致不孕不育。且如果母亲孕育胚胎早期，长期接触有害物质，比如射线、副注射等，同样也会诱发：母亲孕育胚胎早期，引起睾丸不发育或发育不良，所以若男性有生育下一代的需求，需要尽量想办法防止将Y染色体缺失传给下一代。
总之，如果异常只在y染色体上，生女儿就不会有什么问题，这种情况只能通过人工助孕的手段实现，毕竟自然受孕的话，生男孩和生女孩的概率是一样的，都占50%,具有遗传风险，所以备孕的夫妻要考虑清楚再做决定，或者可以询问一下医生的建议。
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