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根据相关了解，X染色体是控制智力的，母亲的X染色体上基因决定孩子大脑皮层的发育程度，父亲基因则可能对塑造后代的情感以及性格类型有着重要影响。而在非性染色体上的大约70个基因影响着智力。第5,9,10,13,18,21,22号染色体的异常都会导致智力障碍。另外要注意，智力除了与遗传有关，与环境、营养、教育等后天的因素也密切相关，所以对于存在智力低下的患者，通过后天的训练，也能一定程度上得到改善。
y染色体上一般是没有智力基因的，不仅如此，与其他染色体相比，Y染色体却相对较小，携带的基因数量有限，仅有27个，其中包包括SRY基因，即性别决定基因，以及一些与精子生产和性别发育相关的基因。此外，还有一些似乎对生命至关重要的基因，尽管我们对它们的功能了解还不够深入。
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