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根据相关了解，女性多囊肾做试管婴儿生育三个孩子是否可以阻断遗传，需要看患者到底是选择的哪个助孕项目，如果是做一二代试管婴儿的话，则是不能阻断的。但如果选择的是第三代试管婴儿，则可以在一定程度上阻断多囊肾基因的遗传，只是并不能完全避免，毕竟该疾病也可能会出现自发产生的情况。
女性多囊肾做试管婴儿可能会成功，但数据相对比较低，可能只有30%至40%。然而，这一数字并非绝对，因为成功率会因个人情况而异。如果多囊肾患者的病情比较轻微，囊肿比较小，并且体内的囊肿数目比较少那么三代试管婴儿的成功率可能会比较高，可能在50%至60%之间。
相反，如果患者的病情比较严重，囊肿较大，并且体内囊肿数目多，那么成功率就会相应降低。另外要注意，夫妻二人的年龄也会对其造成影响，其中女性患者的年龄增长，会导致卵巢功能逐渐减退，从而使得妊娠率明显降低；而男性年龄的增加，也会导致精子质量下降，这不仅体现在精子浓度、活动力方面，还可能影响精子的遗传物质，比如精子DNA碎片率、抗精子抗体升高等方面。
女性多囊肾做试管婴儿一般是有风险的，因为多囊肾可出现囊肿破裂出血或引起尿路梗阻等危害，还会出现泌尿道和囊肿感染，表现为膀胱炎、肾盂肾炎、肾周脓肿等等。如果一直不治疗的话，随着疾病的发展还可能会导致肾功能衰竭。此外，多囊肾还会引起心脏瓣膜异常、结肠憩室、颅内动脉瘤等。
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