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南京鼓楼医院的生殖医学中心是公立的，患者可以放心就诊。从临床来说，南京鼓楼医院的生殖医学中心是江苏省妇幼保健重点专科、江苏省“十二五科教兴卫工程”生殖医学创新团队，同时还是国家卫生部首批批准开展人类辅助生殖技术5家单位之一。另外，南京鼓楼医院的生殖医学中心年接诊不孕症患者12万余人次，体外受精-胚胎移植年周期数超过5000周期，临床妊娠率一直保持60%以上。
南京鼓楼医院的生殖医学中心成立于2001年，该中心并不是几级医院。从临床来说，南京鼓楼医院的生殖医学中心位于中山北路，医疗用房面积6000m2，该中心常规开展宫腔内人工授精技术(IUI)、体外受精-胚胎移植(IVF-ET)、卵细胞浆内单精子注射技术(ICSI)、配子与胚胎冻融技术等一系列辅助生殖技术，临床妊娠率及分娩率继续保持国际领先水平。
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