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上海交通大学医学院附属瑞金医院擅长烧伤整形科、内分泌科、血液内科、传染感染科、呼吸科等，其中烧伤整形科最厉害，科室创立以瑞金烧伤补液公式、混核移植方法、冬眠疗法等为特色的大面积烧伤救治方法，被誉为“中国方法”，成功救治三度烧伤面积90%以上病人6例（1例烧伤总面积达100%，III度94%），居世界领先水平，已成为以大面积烧伤救治为特色的烧伤中心。
另外，上海交通大学医学院附属瑞金医院的内分泌科也不错，专业形成于上世纪50年代，60年代成立上海第二医科大学内分泌实验室，70年代末成立上海市内分泌研究所。目前本专业是国家教育部重点学科、211工程重点建设学科、国家卫生部内分泌代谢病重点实验室、国家药品和食品监督管理局药品临床试验基地。总的来说，瑞金医院擅长的科室有很多，是一个不错的医院。
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