上海瑞金医院的医疗设施很先进，而且医生临床经验丰富，擅长诊治不少疾病，例如急性坏死性胰腺炎、生殖医学、内分泌、高血压、中医伤、肾脏等。从临床来说，瑞金医院最擅长的是内分泌，这个科室是国家重点建设学科，国内最主要的内分泌代谢专业医师进修基地之一。同时在许多方面形成自己的特色，与国际先进水平同步发展。

另外，上海瑞金医院看血液科也不错，该科室是国内最具国际影响力的血液疾病综合诊治中心，引领我国血液系统疾病诊疗体系建设及血液学科医疗、教学、科研工作。除上述科室外，医院还擅长放射科、肾脏科、风湿免疫科、麻醉科、皮肤科、普通外科等重症医学科相关疾病的诊治，均拥有高超的诊疗技术，为患者就医提供可靠基础和保障。

上海瑞金医院擅长皮肤科的，该科室是集医、教、研为一体的专业科室，上海交通大学医学院重点学科，国家住院医师培训基地和临床药理基地，承担国家级继续教育项目。另外，该科室在国内以诊治复杂、危重皮肤病闻名，尤其是自身免疫病和皮肤淋巴瘤，近10多年来，在银屑病、药疹、湿疹、痒疹等炎症性皮肤病，天疱疮、类天疱疮、红斑狼疮、皮肌炎、白塞病、硬皮病等自身免疫性疾病进行了创新性治疗，使这些疾病的缓解率或治愈率、生存期都显著提高，死亡率与并发症都显著降低。