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男方有乙肝小三阳做第三代试管婴儿着床率高，因为三代试管婴儿比较先进，成功率也比第一代试管婴儿和第二代试管婴儿高一些。当然，由于存在个体差异，每个女性的身体素质不同，所以具体成功率需要结合自身的实际情况来进行判断，不能一概而论。
如果男方有乙肝小三阳，在一定程度上会影响精子质量，如果精子有问题，和卵子结合形成受精卵后培养出的胚胎质量也有问题。而第三代试管婴儿，三代试管在胚胎移植前的筛选上比较先进，医生在移植前会对胚胎进行遗传学诊断，即利用pgd技术来排除基因缺陷，判断胚胎是否存在染色体异常等方面的问题，从而筛选出健康的胚胎移植，提高移植成功率，让患者生下健康的宝宝。
此外，男方有乙肝小三阳做试管几代还要看病情程度，如果在男性身体健康，有抗体对做几代试管没有要求。这主要就是看女性身体情况了。如果女方有不孕症，例如多囊卵巢综合征、排卵障碍等，做第三代试管婴儿成功率会高一些。且需要注意，乙肝有传染性，试管怀孕后一定要有效阻断该疾病的传播才行。
总之，一代、二代、三代试管婴儿各有各的好处，建议患者在试管前做一些精液常规以及其他方面的检查，评估一下身体情况，综合自身条件根据医生建议选择。
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