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不孕不育症夫妇做试管婴儿怀的胎儿可能会有法洛四联症状，因为该疾病与遗传、孕期暴露和其他诱因有一定关系，其中遗传上有影响神经嵴细胞和第二生心区的相关基因存在，包括NKX2.5基因、GATA-4基因、FOG2基因、JAG1、TBX1、Cx43等，上述基因的存在可能导致神经嵴细胞迁移到心室流出道、主动脉-肺动脉隔以及部分心室的过程中发生障碍，从而引起法洛四联症的发生。
试管做的胎儿可能会有畸形风险，这与受孕方式没有太大的关系，而是与受孕条件及怀孕环境有关，所以如果促排期间父母保持良好的生活习惯，保证精子和卵子健康，那么产生畸形的概率是极小的，但如果在使用促排药物期间还是存在不良生活习惯。
例如抽烟喝酒等等，则可能会影响到精子和卵子的质量，从而增加胎儿畸形的风险，不仅如此，在孕期有存在病毒或者是细菌感染的情况，也是会在一定程度上增加畸形的风险，因此通过试管怀孕后，还需要在医务工作人员的指导下进行排畸检查。
试管婴儿是可能发生胎停的，其发生的原因主要包括胚胎的基因异常、母体激素水平异常和宫腔环境异常。但并非所有试管婴儿都会发生胎停，每个人的情况都会有所不同。因此如果孕妇在怀孕过程中有任何不适，应立即寻求医生的帮助，这样能在一定程度上降低胎停育的风险。
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