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根据相关了解，试管婴儿质量并不是就比自然生的好，但也不能说明自然怀孕的胚胎质量就比试管婴儿好，因为具体还是要看患者的体质和生殖细胞等级。只是有一点要注意，试管婴儿确实是比自然生育更符合临床上的优生优育原则的。
因为做试管医生会给患者做精液优化处于之后再与卵子结合，同时在培养胚胎期间也是对胚胎质量的检验，只有质量好的胚胎才能在体内发育的较好，除此之外，三代试管还会对胚胎染色体进行筛查，排除有异常的胚胎，最大可能的保证胚胎的健康。
三代试管孩子不一定会健康，因为其他非遗传性因素的影响，如环境、生活方式和营养等，仍然可能导致孩子的身体出现健康问题。但该项目可以筛查七十多种遗传性疾病，因此能显著降低遗传病和染色体异常的发生风险，提高出生健康的概率。只是如果是非常罕见的疾病，则可能检查不出来，毕竟全球已知具有遗传性质的疾病有上千种。
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