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正常情况下，二代试管男方要做生殖器的检查，如睾丸、附睾、精索静脉的彩超，以了解睾丸发育、附睾囊肿、精索静脉曲张情况，不仅如此，还需要做血常规、尿常规、血型、乙肝五项、丙肝、艾滋病梅毒抗体，以及，精液常规等项目。
其中精液常规检查至少需要检测2次，以了解精液情况，精浆生化、分泌物的衣原体、淋球菌化验，针对两广、福建、江西、湖南、海南，以及云贵川等地区的患者，可能还需要做地贫基因检测，毕竟该疾病有一定遗传性。另外，无精症的患者需要做睾丸附睾穿刺抽吸术或者睾丸活检术来确定是否有精子，以及y染色体微缺失检测。等这些项目的辅助检查全部完成后，医生还会根据女方情况来确定试管婴儿方案。
正常情况下，男性患者做二代试管婴儿将精液取出后，一般是需要经过实验室进行筛查的。因为二代试管是指单精子卵胞浆内注射，适合精子数目较少或精子活力较弱，以及有梗阻性无精症的患者。通过睾丸或附睾穿刺获得的精子，如果活动力差或数目不够，需要进行二代受精。
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