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三代试管最难的一关是取卵，因为在临床上卵子的质量决定了胚胎质量，而卵子的多少决定了累计培育胚胎的数量，同时在取卵期间试管患者为了促排卵，不仅要注射许多排卵针，还要承受一定的心理压力，以及承受身体上的伤痛，因为在取卵的是要进行取卵手术，用穿刺针取出卵巢内的卵泡，术后患者会有一定的疼痛感，并且有的患者并不是一次就能够成功取卵，可能还会进行多次，所以对于患者来说也是备受煎熬的。
试管最难熬的三个阶段分别是促排卵、取卵和胚胎移植，其中促排卵阶段难熬是因为女性患者需要每天注射促排卵药物，通过药物控制促进多个泡成熟并排出，一般要持续8-12天左右；而取卵则是因为该手术需要穿刺针刺激卵巢种进行吸附取卵，患者可以明显感觉到有小型吸尘器在自己的身体中进行运作。
最后就是胚胎移植了，如果前面只是身体上的难熬，而胚胎移植则是心理上的煎熬，毕竟这是人类辅助生殖项目的最后一步，夫妻二人都会非常紧张和担忧，很害怕出现失败的情况，只是要注意，每个不孕不育症夫妇的情况不同，因此感觉到的难熬阶段都是不一样的。
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