重庆市妇幼保健院的三代试管婴儿不可以报销，只能自费。一般来说，在一些特定地区如上海市自2024年起开展了生养基金制度，为不孕不育夫妇提供一定比例的试管婴儿费用报销。此外，一些商业健康保险可能会对第三代试管婴儿的费用进行报销，但具体政策因保险公司而异。公益基金和互助平台也为符合条件的患者提供报销服务。

总的来说，目前国家公共医疗制度中试管婴儿的费用一般不能报销。但是，通过购买特定的商业保险，可以根据保险协议进行报销。因此，如果您所在地区没有相关的医保或生育保险政策支持试管婴儿费用报销，您可以考虑购买商业保险来减轻经济负担。另外，这里建议与当地相关部门或保险公司进行详细了解和沟通，以便更好的节省试管费用。

在重庆市妇幼保健院期间，做试管婴儿的话，通常来说不能使用男方医保，女方也不可以，因为不在报销范围内。一般来说，目前只有北京试管婴儿可以报销，例如促排卵检查、宫腔内人工授精术等在内的16项治疗性辅助生殖技术项目将纳入北京基本医疗保险门诊甲类报销范围，北京普惠健康保最高减免5000元，报销申请时直接享受折扣。总的来说，对于所在地区没有将试管婴儿纳入医保报销范围的居民，可以选择商业保险，以减轻经济压力。目前有多款全国版试管婴儿保险可供选择。