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29岁查出衣原体阳性做试管是会影响鲜胚移植和着床的，之所以衣原体会阳性是因为没有做好个人的清洁护理，导致阴道受到感染。衣原体阳性就会影响正常的月经周期，但试管婴儿促排期间就需要月经正常，所以是不能做试管移植的。因此，这里建议姐妹们要注意身体的清洁，勤换内裤勤洗澡，预防阴道受到感染。
衣原体阳性在初期会阴道瘙痒、白带增多、尿频，如果不引起重视，也不进行相应的治疗，就会使病情加重导致整个泌尿生殖系统出现问题。对于怀孕的女性来说，衣原体阳性是会影响胎儿的，有可能会导致孕期出现流产、早产、宫外孕等异常情况，且衣原体阳性也会使胎儿感染以至于患有咽炎、肺炎等病情。
总得来说，衣原体阳性初期不严重的时候还是可以治疗的，可在医生的指导下使用阿奇霉素、左氧氟沙星、罗红霉素等药物进行治疗，如果是怀孕的女性衣原体阳性，则可以使用红霉素药物。除此之外，也要做好个人洗漱用品隔离，避免与家人共用毛巾、浴球、浴巾等，防止家人也受到感染。
不过，在试管移植前期查出衣原体阳性也不用过于紧张，衣原体并不会影响试管成功率，只要积极配合医生治疗即可，还需要注意的是在治疗期间不能同房，且衣原体转阴三个月后才能再次进行试管移植。
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