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正常情况下，女性患者做二代试管婴儿一般是不会筛查胚胎染色体的，因为该项目主要是指单精子显微注射技术，直接将单个精细胞注入卵细胞来帮助卵细胞受精。然后观察精子、卵子的受精情况，一般是针对男性精子受精能力的问题而发展的，提高了卵子受精的成功率。适用于男性精子原因造成的不孕症，如畸形活精子症，精子数目过低，克氏综合征等。
而胚胎染色体检测，一般属于第三代试管婴儿，主要是指从体外受精第三日的胚胎或第五日的囊胚取1到2个卵裂球或部分滋养细胞，进行细胞和分子遗传学检测，检出带致病基因和异常核形的胚胎，将正常基因和核心的胚胎移植，得到健康的后代。主要用于单基因相关遗传病，染色体病，性连锁遗传病及可能生育异常患儿的高风险人群等等。
不孕不育症夫妇做二代试管婴儿一般是不能检测胚胎性别的，因为显微镜下观察胚胎无论是形态，还是分裂速度，没有办法区别男女性别，而目前在试管婴儿中只有胚胎基因检测可以判断性别，但国内有法律规定，禁止任何非医学需求进行胚胎性别鉴定和筛查，因此除非存在伴性遗传性疾病，其他人都不能进行检测。
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