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根据相关了解，第三代试管体外受精和培育期间可能会基因突变，只是要注意，由于该项目中需要对生殖细胞进行胚胎基因检测，主要是提取胚胎或者是囊胚的部分遗传物质进行分析，然后排查有问题的胚胎，再选择正常的生殖细胞进行种植，这样成功率会更高一些，同时也能在一定程度上保证胎儿的健康。
尽管第三代试管婴儿技术可以大幅降低遗传疾病风险，但仍然无法完全排除突变的可能性。根据研究第三代试管胚胎的基因突变概率大约为0.1%至0.5%。这意味着虽然风险较低，但仍然存在一定程度的不确定性。因此在三代试管怀孕成功后，还需要定期前往医疗机构进行排畸检查，以此来了解腹中胎儿的具体情况。
正常情况下，不孕不育症夫妻做第三代试管婴儿出现基因突变可能是由于操作不当、实验室污染等因素导致的，另外也可能是由于异常受精，或者是分裂异常导致的，这些都可能会使得胚胎基因突变，只是还有一点要注意，如果夫妻双方本身存在基因突变，那么也有可能会遗传给子代。
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