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海军特色医学中心在上海市，并不是莆田的医院，在为部队官兵提供医疗保障的基础上，也同样承担着为民优质服务的社会职能。从临床来说，人民解放军海军特色医学中心是海军的特勤医疗救治基地，也是集医疗、教学、科研、预防、保健为一体的军队三级甲等综合性医院。另外，海军特色医学中心潜水医学处于亚洲领先、世界先进水平，航空与航天医学在国内有突出影响，其他医疗学科各有特色和成果。
海军特色医学中心是一家承担海军特种医学研究与教学、航海航空疾病预防控制任务，也承担着为百姓服务的社会职能的医院。从临床来说，海军特色医学中心开设45个专业，30个科室，900张床位，年收治病人2.1万人次，门急诊量46万人次，年手术量9000余例次。另外，海军特色医学中心医疗设备齐全，拥有PET-CT、核磁共振、DSA、全身伽玛刀、射波刀、320排CT以及进口血透机等一大批现代化诊疗设备，其综合实力处于全国领先地位。
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