上海九院是正规医院，也是国内知名的三级甲等综合性医院。从临床来说，上海交通大学医学院附属第九人民医院的前身是伯特利医院，该院创建于1920年，1952年更名为上海第九人民医院，1964年正式成为上海第二医科大学附属第九人民医院。

另外，由于2005年上海第二医科大学与上海交通大学正式合并，从此改名为上海交通大学医学院附属第九人民医院。目前来说，医院有临床科室33个，医技科室9个。全院职工2200余人，医疗专业技术人员占82%以上，其中副高职称以上专家350余人。

上海九院不是专科医院，而是综合性医院。从临床来说，上海九院是一所以口腔、整复外科和骨科为特色的内、外、妇、儿各科齐全的三级甲等综合性教学医院，其中口腔医学、整复外科学、骨科学为教育部第三期“211工程”重点建设学科，口腔黏膜病科列为国家中医药管理局重点专科，组织工程学为上海市“重中之重“学科，口腔颌面外科为上海市重点学科(优势学科)，口腔修复生物材料学为上海市重点学科(特色学科)，口腔基础医学和眼科学为上海市第三期重点学科，骨科为上海市教委重点学科。眼科、麻醉科、泌尿外科、内分泌科为上海交通大学医学院重点学科。