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男方y染色体c缺怀孕后是可能睡导致胎儿畸形的，且会影响到试管婴儿的助孕成功率，一般y染色体c缺一次的助孕成功率在50%左右，其觉有一定遗传性。所以通常情况下，建议患者选择女宝宝来正常的生育，即做三代试管婴儿，选择出健康的x染色体胚胎进行移植，可以在很大程度上避免遗传性疾病。
男性y染色体c段微缺失是身体中没有精子因子，影响身体中精子的形成，大多数情况下是体内睾丸发育不良导致的。这种情况会导致男方不孕，并且会严重影响到受精卵的质量，影响受精卵的发育，导致后期发育异常，从而出现胎儿发育畸形的情况，所以为了优生优育，尽量采用人工助孕比较好。
此外，y染色体c段微缺是一种先天性的疾病，说具有遗传几率。生育的男性宝宝100%遗传AZFc缺失基因缺陷，孩子之后也会出现和父亲一样的症状，比如生精功能出现障碍，睾丸发育不良，表现为的女性特征等，且后代的病情还可能会不断加重。
总之，大概一半的y染色体c微缺患者可以经睾丸穿刺获得精子做试管婴儿，但是也有部分男性情况严重，取不到精子，这种情况想要小孩的话只能做供精试管婴儿，即选用医院提供的健康精子进行授精移植，可以百分之百避免遗传，但至于胎儿是否会发育畸形，还不能保证，毕竟导致胎儿畸形的因素很多，不单单是由精子质量决定的。
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