羊穿通过但基因芯片检查没过胎儿发育有没有问题是说不准的，有可能会有问题，但也有可能不会有问题，当出现这种情况时，可能是由于胚胎患有遗传性疾病导致的，孕妇应该在医生的指导建议下看看是否需要终止妊娠。

基因芯片其实就是诊断胎儿先天性遗传疾病的一个金标准，很多在经过羊水穿刺的孕妈会被要求再做一个基因芯片的检测，但是有些孕妈可能会因为芯片价格更高等原因放弃芯片检查，但其实基因芯片的好处是非常多的，具体如下：

1. 1、更全面：羊水穿刺后取得的标本可以用于染色体核型分析，然后染色体核型分析针对染色体的数目和大片段缺失、重复和染色体易位，但是，对小片段的染色体片段缺失或重复不能检出，而芯片能检出微小的染色体片段重复或缺失；
2. 2、更精准：基因芯片检查主要是针对一些年龄比较大的高龄产妇要做基因检测或者是羊水穿刺，以后可以根据自己的情况来进行选择，而羊穿是检测胎儿的所有dha的，可以有效的排除三体综合征，通常来说两种方式都是鉴别基因的一种方法，只是相对来说基因芯片的检查会比较精准一点，可以检查一些比较小的病变以及错位，有效的排除先天性的遗传性疾病；
3. 3、针对性高：羊穿芯片是针对曾经有过流产史，或者是曾经有过基因方面的胚胎发育的过程，这种情况下在做羊水穿刺的时候有必要加基因芯片，家族或者产妇本人或前次妊娠有涉及胎儿基因疾病或基因组疾病的情况下，也会加做芯片。