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根据相关了解，16号染色体缺失做试管的危害是降低试管婴儿成功率，但如果患者做第三代试管婴儿的话，一般是没有太大影响的，只是如果没有检测到异常，并成功怀孕了孩子，则可能会导致宝宝出现自闭症，或者是先天愚型等情况：
1、自闭症：如果16号染色体缺失存在，可能会导致孩子出现社交问题，比如缺乏与家人的眼神交流，缺乏面部表情，或者在表达意愿时，只能通过点头、摇头来表达，或者沉默、呆滞，这都是自闭症的表现；
2、先天愚型：如果胎儿存在 16号染色体缺失的问题也可能有先天愚型，如两眼间距变宽、鼻根低、斜侧眼等。有的孩子可能会出现外耳小、经常吐舌头、流口水，或者啫睡、吃饭困难等症状。
以上就是16号染色体缺失做试管的危害，但每个人的身体情况都是不一样的，出现的症状也是不一样的，毕竟16号染色体缺失的比例和长度不一样，症状程度也是不同的，因此具体情况如何，建议各位不孕不育症夫妇以自身实际情况为准。
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