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目前国内公立医院除了患有某些伴性遗传病以外，都是不能进行精子分离术的，要想使用精子分离术做试管生男孩只能去某些私立医院，但是这些医院的费用相较而言会高出很多。
三代试管婴儿授精的方式，是采用单精子卵泡浆内注射技术，所以耗费也比一代试管婴儿的费用大。另外还需要冷冻胚胎及胚胎复苏，这些都会增加三代试管婴儿的费用。
第三代试管婴儿的费用：
1、公立医院：除去前期检查费用，国内公立医院大概需要10万左右；
2、国外医院：医疗费大概在12万左右，加上中介费、翻译、食宿等开销，总共大约需要16万左右。
3、国内私立医院：根据不同套餐选择，费用大概在16万~30万之间。
费用具体包括几部分：术前检查费用、促排卵药物的费用、手术及实验室操作费用、胚胎冷冻费及胚胎管理费等。由于不同的人身体状况不同，所用药物可能也不相同，所以费用是不固定的。但是如果想要在比较大的、正规的私立医院做三代试管婴儿生男孩的话，15万可能是不太够的。
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