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在北医三院检查胚胎染色体的费用大约在2000-5000之间，但要根据情况来分析，如下：
1、如果只是单纯的针对染色体的条数进行检测，也就是G显带技术进行检查的话，花费是比较便宜的，可能在2000左右；
2、如果针对胚胎的染色体进行微缺失或微重复的检测，这个花费就会比较高，大概3000-4000元；
3、如果需要针对某一个基因来进行检测的话，可能还需要额外增加费用，需要5000甚至更多。
总的来说，每个地区医院级别、检查项目具体内容以及检查项目所需的成本不同，具体费用建议咨询当地医院。另外，关于检查流产胚胎染色体费用的问题，可以与医院医生详细沟通情况，选择适合自己情况的检查项目。
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