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研究表明这一现象在囊胚期可能达到30%。胚胎在受精卵细胞分裂发育的阶段，部分细胞的染色体拷贝发生错误，而这些错误并没有导致这些细胞死亡，而是继续分裂，就导致胚胎中部分细胞的染色体异常， 也就是我们说的嵌合体，嵌合体产生的原因目前没有定论，主要跟胚胎形成后早期细胞分裂异常有关。
其实在早期的胚胎发育中，发生染色体嵌合现象非常普遍，既往研究胚胎嵌合体发生率不一，从30%到90%不等，每个人的情况都不同，临床上普遍认为异常细胞占比20%到80%为嵌合体胚胎，大于80%为非整倍体胚胎(不正常胚胎)，小于20%为整倍体胚胎(正常胚胎)。
对于嵌合体胚胎是否应该移植目前仍然有争议，大部分的医生都认为嵌合体胚胎移植后的着床率比移植正常胚胎下降，而且流产率会增高，但不是绝对不怀孕或者绝对会流产，还是有很多嵌合体胚胎能够顺利着床并怀孕到足月的，所以想移植嵌合体胚胎就要考虑移植胚胎的嵌合比例。
检测出带有嵌合体的囊胚，医生一般不建议客户进行移植，除非患者已无其余可移植胚胎，且患者家庭已明确知道嵌合体囊胚移植后的风险，并签订相关知情同意书后医生还得视囊胚嵌合比例情况而定才可进行移植，而且，理论上所有嵌合体囊胚移植后都应该定期检查胎儿的染色体核型，建议对于移植嵌合体胚胎妊娠的女性产前都应该进行羊水穿刺，检查胎儿发育情况。
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