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上海长海医院属于军队系统的医疗单位，也是军级单位。从临床来说，上海长海医院在1999年荣膺“全国百佳医院”称号，先后被评为全国“支援西部地区医院工作先进单位”，全军“思想政治建设先进单位”、“医院文化建设先进单位”、“为部队服务先进医院”等。
另外，上海长海医院现有国家临床医学研究中心1个，国家级重点学科15个，国家卫生部临床重点专科5个，全军医学专科研究所（中心）18个、重点实验室2个，全军或上海市护理示范基地10个、上海市重点学科1个等，其中胰腺疾病和前列腺疾病诊疗团队入选“国家教育部创新团队”。
上海长海医院不是国企，而是公立医院，属于事业单位。从临床来说，上海长海医院位于东海之滨、黄浦江畔，该院医疗服务特色鲜明，拥有亚洲一流水平的门急诊大楼，全球最先进的达芬奇手术机器人系统，是是国家执业医师资格考试临床实践技能类考试基地、上海市住院医师规范化培训全科临床基地，全国、全军护理优质服务示范医院等，其门急诊总量首次突破300万人次，医疗发生额突破30亿，手术4.69万例次，出院人数8.86万人次，平均住院日7.8天。
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